More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1257 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  99.55 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 244 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  82.59 
 
 		 222 aa  337  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  51.53 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  41.36 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  35.61 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.78 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  34.25 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.14 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.56 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.13 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.92 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  36.89 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.5 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.5 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.5 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  37.31 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  37.31 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.93 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.21 
 
 		 205 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  44.7 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  44.7 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.73 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.95 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.83 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.76 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.86 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.83 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.5 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.62 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.35 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  32.23 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  29.55 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  29.55 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  37.68 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.74 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  31.48 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>