More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0500 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  25.75 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  35.44 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  32.56 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  33.9 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  41.38 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 174 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 200 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 184 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>