151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11710 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 
237 aa  454  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  46.31 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  46.41 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
266 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 
211 aa  118  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  37.7 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  35.16 
 
 
246 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
217 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
235 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
235 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
235 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  36.76 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.09 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.82 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
469 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.43 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
217 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
212 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
212 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
212 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
194 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.81 
 
 
226 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  28.24 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 
196 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
205 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  29.66 
 
 
197 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  31.55 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
205 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
195 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
198 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 
199 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>