More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3112 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 238 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  60.27 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  57.8 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  49.76 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  41.59 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  36.21 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  36.06 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  30.33 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  32.8 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.44 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  20.98 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 188 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>