278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4602 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 275 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  25.68 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.08 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  30.81 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  29.53 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.02 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  32.67 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  27.96 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 307 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.89 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>