283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2889 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  80.98 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  80.79 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  82.09 
 
 		 213 aa  332  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  71.57 
 
 		 213 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  71.08 
 
 		 213 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  71.78 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  71.78 
 
 		 212 aa  291  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  71.78 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  71.78 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  72.28 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.79 
 
 		 215 aa  287  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  70.79 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  70.79 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.79 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.3 
 
 		 215 aa  286  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.79 
 
 		 215 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.79 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  70.79 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.79 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.3 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  70.79 
 
 		 212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  67.88 
 
 		 205 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  67.36 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 204 aa  258  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 204 aa  257  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 225 aa  257  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  66.32 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.8 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.8 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.8 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.8 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  62.81 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  63.05 
 
 		 210 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.8 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.28 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.97 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  64.4 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.81 
 
 		 202 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.08 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  45.03 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  40.1 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 210 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  34.88 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  92  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  32.99 
 
 		 201 aa  92  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  31.76 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  31.76 
 
 		 279 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>