162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5613 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  77.56 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 210 aa  321  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  73.04 
 
 		 210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  73.04 
 
 		 210 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  73.04 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  72.12 
 
 		 211 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  72.12 
 
 		 222 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  37.31 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  37.31 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.89 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.31 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.59 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.63 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  34.76 
 
 		 231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.27 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.63 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.87 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.82 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  33.18 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.83 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  35.32 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.33 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.47 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.87 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.47 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  43.65 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.18 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.35 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  43.8 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.21 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  28.96 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  28.42 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  30.2 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.56 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25170  transcriptional regulator, tetR family  30.56 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193218  normal  0.642579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>