89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2300 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  91 
 
 		 229 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 226 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  43.06 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  43.54 
 
 		 284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.73 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.84 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.84 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.84 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  36.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  36.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.79 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.81 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.82 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.16 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  34.55 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.68 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.82 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.84 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.34 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.37 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.37 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.37 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.92 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.37 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.86 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.16 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.89 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.89 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.41 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.03 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  30.14 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.59 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  34.34 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.37 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  29.25 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.83 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 193 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  32.22 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>