77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1272 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  82.5 
 
 		 229 aa  328  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 229 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 279 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.25 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  38.36 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  38.36 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.36 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.25 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.96 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.96 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.96 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.96 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.25 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.95 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.06 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.92 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  34.19 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.55 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.76 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.33 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.51 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.12 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.94 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.5 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  31.39 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.16 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  27.83 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  29.7 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.58 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  46.51 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  26.62 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>