170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10480 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  85.15 
 
 		 235 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  85.15 
 
 		 235 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  85.15 
 
 		 235 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  84.02 
 
 		 227 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  80 
 
 		 234 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  48.2 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  33.87 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  32.96 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  29.36 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  34.25 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  25.4 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  24.19 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.49 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 204 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  26.26 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  31.2 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  27.18 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  45.1  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>