157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3791 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  81.04 
 
 		 208 aa  349  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 208 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 208 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  65.24 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  28.31 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  25.38 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  27.74 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  27.07 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  33 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 310 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  31.46 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  22.07 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  30.28 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  28.95 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  28.28 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>