More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5533 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  30.46 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  37.2 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 186 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
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NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
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NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 415 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  44.58 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
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NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 179 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
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NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  42.35 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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