More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2362 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 168 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 208 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 415 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.87 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  29.41 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  48.21 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>