106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0626 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  67.93 
 
 		 228 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0418  hypothetical protein  43.18 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  28.12 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  45.83 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 183 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.18 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>