209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5132 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.06 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  27.43 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  37.65 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  35.64 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  50 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  38.57 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  25.28 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.83 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.83 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>