More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0626 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.05 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  44.9 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  55.1 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.94 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>