More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3090 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.28 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  24.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.58 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.58 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  25.84 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  26.17 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  29.11 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.17 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  19.47 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>