More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3665 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  49.46 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  53.01 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  49.26 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  41.98 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  42.03 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 332 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  46.81 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>