More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3730 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 237 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  45.16 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 183 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  60.78 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  37.97 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  32.29 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  32.53 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  49.02 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>