More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1473 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 218 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 207 aa  72  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  33.74 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  29.05 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  29.11 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  29.11 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  29.11 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  29.11 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  29.11 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  29.11 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  29.11 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 324 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  29.51 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>