226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1609 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  45.49 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0290  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1651  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4183  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  26.11 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2533  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1585  regulatory protein, TetR  24.55 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000139754  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0326  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0277  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4177  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1415  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3627  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0298  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.985491  normal  0.0279616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 412 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  36.14 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  37.84 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 199 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>