More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2512 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 324 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  34.26 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.48 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  47.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>