More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2683 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  65.14 
 
 		 228 aa  292  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  55.39 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.93 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  29.59 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.75 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  23.15 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.23 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  23.12 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  24.75 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  25.52 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  26.87 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  23.81 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  30.08 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  20.31 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  22.4 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  29.49 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  23.71 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  23.16 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  26.01 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  25.67 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  26.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>