177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003710 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1651  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.5 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  24.84 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  21.8 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 201 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 198 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  24.42 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  36.67 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3997  hypothetical protein  22.6 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.435374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0279  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.350213  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 193 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>