91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1551 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  75 
 
 		 196 aa  313  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  72.96 
 
 		 196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  57.14 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  39.59 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  27.46 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 226 aa  85.5  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  27.46 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  21.3 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  21.39 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 276 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  21.57 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  27.62 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.14 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  24.26 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  24.17 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  21.57 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  26.44 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  20.41 
 
 		 200 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 207 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 214 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  20.92 
 
 		 208 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>