130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1636 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  36 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  36 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  35.43 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  28.16 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  25.81 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  26.44 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  29.08 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  23.45 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  25.88 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3997  hypothetical protein  31.18 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.435374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  40 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>