110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3546 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  92.12 
 
 		 203 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 203 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 203 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 203 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  77.34 
 
 		 203 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  77.34 
 
 		 203 aa  308  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  76.35 
 
 		 203 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  74.88 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  54.77 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  38.14 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  38.98 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  39.77 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  29.24 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  29.24 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  28.07 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  27.17 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  24.14 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  23.11 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  22.28 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  43.14 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  20.51 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  24.46 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  23.01 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  23.38 
 
 		 205 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 203 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 199 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 184 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 219 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 195 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 195 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 403 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 248 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>