126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0686 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  24.59 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 182 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30.39 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 175 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  36.99 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 192 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  46.81 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>