139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2527 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 72 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  20.96 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  19.89 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  23.67 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 247 aa  47.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  20.12 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  18.01 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  18.01 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  23.53 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  19.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  20.72 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  19.38 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  26.74 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  16.87 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 376 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  21.19 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  21.17 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  26.92 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 286 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 218 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  20.22 
 
 		 217 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 214 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>