110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3613 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  69.13 
 
 		 234 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  31.65 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  36.45 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  24.55 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32.93 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  36.62 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  25.75 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  34.43 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  33.82 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 212 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>