More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2290 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  96.12 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  96.12 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  96.12 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  96.12 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  72.68 
 
 		 206 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 206 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  71.36 
 
 		 206 aa  287  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  70.39 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  64.22 
 
 		 206 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  61.58 
 
 		 205 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 231 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 326 aa  68.2  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.9 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  44.62 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.34 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
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NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.9 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
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NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.9 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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