145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1605 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.89 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  31.63 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  31.77 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  27.89 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  28.24 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.65 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  32.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>