250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  88.89 
 
 		 189 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  34.03 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 209 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.96 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  32.28 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  32.8 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  32.96 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  22.11 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.27 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.32 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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