More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2798 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  74.26 
 
 		 210 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  60 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  37.37 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  38.61 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  39.39 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 204 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 213 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.67 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  35.02 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 220 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 207 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.94 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.42 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  25.57 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.5 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  28.92 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
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NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  28.11 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  26.21 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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