More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2164 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 770 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 437 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  45.24 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.93 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 424 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 424 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  25.67 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>