More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2843 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  92.19 
 
 		 193 aa  362  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  86.83 
 
 		 209 aa  358  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  85.1 
 
 		 209 aa  354  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  82.78 
 
 		 209 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 209 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 209 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  84.97 
 
 		 193 aa  313  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  31.35 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  29.9 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  30.88 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  25.93 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  23.08 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
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NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  27.51 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
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NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
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