271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4071 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  80.83 
 
 		 193 aa  318  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  37.21 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.8 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  30.32 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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