More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3237 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 193 aa  296  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 193 aa  294  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 193 aa  294  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  74.73 
 
 		 194 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  36.22 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  31.76 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 200 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.73 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  29.38 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  27.06 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
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NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  27.7 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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