115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2194 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  34.92 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  34.04 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  22.91 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  24.71 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30.93 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  25.12 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  25.26 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 194 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
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NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 202 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 194 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 184 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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