296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3295 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  80.11 
 
 		 187 aa  263  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  79.56 
 
 		 187 aa  243  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  61.58 
 
 		 186 aa  215  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  63.07 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  59.66 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  59.66 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  58.66 
 
 		 191 aa  188  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  52.05 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  30.41 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  32.97 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 226 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  29.55 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>