More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2179 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.14 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  40.98 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  29.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.91 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.64 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.91 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.91 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.91 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 310 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 424 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  36.84 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 256 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.84 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.84 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.84 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>