More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  339  9e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  59.17 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 188 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  45.4 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  67.27 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  31.41 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 428 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 219 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  50 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 415 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 280 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>