265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1276 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  63.2 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  30.52 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  46.97 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37210  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  34.27 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  31.01 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  30.23 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  34.12 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.28 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  41.86 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 192 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  26.29 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  40.24 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  33.94 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 125 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>