293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37210  transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  30.52 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 321 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 388 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  34.25 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  37.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  37.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  37.93 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  37.7 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  36.78 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 175 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>