130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0478 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 196 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 194 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  34.18 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 203 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 205 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 207 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 251 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 227 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  48.08 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.72 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 195 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 195 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 211 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 207 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 193 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 221 aa  45.8  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  38.36 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  36.76 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  47.92 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 438 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>