284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  373  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  35.62 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  38.24 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  38.24 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  43.1 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 254 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  48 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  43.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 182 aa  50.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  22.29 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  24.56 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  42.11 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  42.11 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  42.11 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  37.68 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>