76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4064 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  99.01 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  98.52 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.6 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 297 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 497 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0896  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00832617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  27.94 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 446 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.24 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 243 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 400 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 180 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 201 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 216 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 196 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  34.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>