More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0403 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 225 aa  121  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  26.34 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  50.91 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  43.1 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  43.55 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  43.55 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  24.26 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  47.06 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  34.04 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  38.67 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  44.64 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  44.64 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  21.72 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  39.06 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  37.33 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  39.06 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 257 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  41.67 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>