146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1274 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  33.56 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  41.25 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  40.24 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  30.08 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  28.26 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  29.82 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  36.07 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 275 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.79 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  40.38 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>