179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0605 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  38.94 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  42.86 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  42.86 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  35 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  43.33 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  48 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  43.55 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  39.44 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  38.1 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  34.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  41.18 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>